最初宝剑骑士团的全名为“宝剑利沃尼亚兄弟骑士团”。组织架构完从上至下共分为二个等级。

第一级：贵族骑士，由各德意志贵族组成，每名骑士辖下数十名武装侍从；

第二级：普通侍从，包括效忠骑士团的民兵，以及服侍贵族的见习骑士和扈从。

其中，作为骑士团之首的无疑是“宝剑骑士大团长”，拥有整个骑士团的最高权威，即是军队的总司令，又是最高行政长官。其次便是副团长、主帅、区队长、骑士等下级骑士军官。

但有一点值得注意，由于宝剑骑士团是主教阿尔伯特一手组建的，所以教皇同意阿尔伯特独立指挥骑士团，也就是说，宝剑骑士团需要听命于主教阿尔伯特，这与其他骑士团直接听命教皇不同，所以其地位自然不如三大骑士团。

随着宝剑骑士团到处征战，周围的土着势力自然十分敌视这帮骑士。公元1217年，爱沙尼亚人联合罗斯人发动反击，一支约6000人马的联军攻入了利沃尼亚。时任大团长的沃尔金当机立断，率领人数处于劣势的3000骑士团主动迎战。

双方会战于菲林森林地区。

两军布阵中，宝剑骑士团以骑士、重骑兵坐镇中央，以当地仆从军为两翼，摆出一幅决一死战的架势。爱沙尼亚联军因成分混杂，显得凌乱不堪。

果然，在双方正式交战中，宝剑骑士团更像职业军团，而爱沙尼亚联军则如同匆忙上阵的民兵，鏖战不久，宝剑骑士团左翼就突破了敌军右翼，并斩杀敌军指挥官。此举使得爱沙尼亚联军指挥系统更加混乱，最终大败而逃。

此后数十年里，宝剑骑士团越战越勇，他们凭借自身优秀的战斗素养，以及来周围势力的增援，不断周旋于教皇、丹麦、不莱梅、罗斯等国之间，拉一派打一派，到公元1227年时，宝剑骑士团联合三大骑士团，征服利沃尼亚和爱沙尼亚大部，成为该地最大地主。